Rapport in het kort
Binnen en buiten het RIVM bestaat er een grote vraag
naar de massaspectrometrische structuuranalyse van biopolymeren en met name
naar de massaspectrometrische bepaling van de primaire structuur van
proteinen. In rapport 638720001 werd vermeld dat uit de praktijk is
gebleken dat de directe massaspectrometrische structuuranalyse van zeer
grote moleculen (molmassa > 3000 daltons) (nog) niet mogelijk is. Wij
behandelen in dit rapport de oorzaken van dit gelimiteerd massabereik. Het
zal blijken dat een eventuele ontwikkeling van de directe
massaspectrometrische structuuranalyse van zeer grote moleculen moeilijker
zal zijn dan tot nu toe werd aangenomen. Een van de kernproblemen is dat
grote moleculen kinetisch stabiel zijn t.o.v. de structuurkarakteristieke
ketenfragmentaties; zulke moleculen zullen overwegend kleine periferische
atomen of groepen afsplitsen. Een ander probleem is gelegen in het grote
aantal laag-frequente trillingen waarin veel energie opgeslagen kan worden.
Omdat grote eiwitten specifiek biochemisch afgebroken kunnen worden tot
fragmenten met molmassa < 3000 lijkt de conclusie gewettigd dat uitbreiding
van het massabereik niet kosten-efficient zal zijn.
